临时指南 2021 年 1 月 8 日 关键信息 SARSCoV2 基因组测序以实现公共卫生目标 • SARSCoV2 基因序列和相关元数据的全球监测有助于应对 COVID19 疫情。这项贡献包括跟踪 SARSCoV2 在地理上随时间的传播,并确保及时检测和评估可能影响致病性、传播或对策(如疫苗、治疗和诊断)的突变。 • 尽管基因测序的成本和复杂性随着时间的推移而显着下降,但有效的测序计划仍需要在人员、设备、试剂和生物信息基础设施方面进行大量投资。此外,需要有效的协作来确保生成的数据具有良好的质量并以有意义的方式使用。 • 鼓励各国将 SARSCoV2 序列快速存入公共数据库,以便与科学界共享,用于公共卫生目的。对 SARSCoV2 分层全球测序网络的投资将有助于开发有弹性、高质量的全球测序计划,以在未来检测和管理其他暴发病原体。背景 在过去十年中,病原体的基因序列数据 (GSD) 在传染病暴发的检测和管理、支持诊断方法、药物和疫苗的开发以及为暴发应对提供信息方面发挥了关键作用 (111)。随着新型冠状病毒(后来被命名为严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARSCoV2))的出现,进一步强调了 GSD 的重要性。在最初识别 SARSCoV2 后的一年内,已通过可公开访问的数据库共享了超过 280 000 个全基因组序列 (12)。...
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